蛋白質全譜分析也可稱為質譜shot-gun分析（鳥槍法），指的是蛋白質質譜檢測，研究對象是完整的組織、血液、體液或其提取物，其目的在于鑒定出盡可能多的肽段和蛋白質。蛋白全譜分析的優勢就是可以全面鑒定整個細胞、組織或復雜混合樣品的大量蛋白質?；谫|譜技術的蛋白全譜分析，可為高通量的蛋白質譜定量和修飾分析提供重要參考信息。

                                                          蛋白質全譜分析圖    

     

                蛋白質提取物：濃度>4μg/μl，蛋白質總量 >5mg;

                細胞樣品：細胞量>108 ;

                組織樣品：濕重>300mg;

                體液樣品：血液體積>1ml