質譜多反應監測技術/選擇反應監測（mrm/srm）是對復雜混合物中目標蛋白質進行定量（absolute quantitation/ relative quantitation）的重要技術手段。mrm/srm作為一種蛋白質組學的質譜分析方法，具有特異性強、靈敏度高、準確度高、重現性好、線性動態范圍寬、自動化高通量的突出優點，是目前非常靈敏的質譜檢測模式，被譽為質譜的“金標準”。
       通過mrm/srm技術進行實時的定量監測可以進行藥代動力學研究、臨床診斷、違禁藥物檢查、食品化妝品等工業質量控制、環境檢測、農業植物學研究以及代謝組學和基于蛋白質組學的生物標志物發現、蛋白質翻譯后修飾等相關研究。       mrm/srm技術是一種基于已知或假定的反應離子信息，有針對性地選擇數據進行質譜信號采集，對符合規則的離子進行信號記錄，去除不符合規則離子信號的干擾，通過對數據的統計分析從而獲取質譜定量信息的質譜技術。
     該方法首先檢測到具有特異性的母離子，然后只將選定的特異子離子進行質譜信號的采集。最終，通過合成同位素形成的目標肽段，將已知濃度的內標肽與待測樣品混合，選擇特定母子離子對獲得不同的色譜檢出信號，比較兩者的信號強度值，實現目的蛋白質的絕對定量。

                                          目標蛋白定量示意圖
        
        質譜定量方法的金標準，被稱為“基于質譜的ELISA”;  
      當今基于質譜重現性較好的技術
      通量高，一次實驗可以平行定量幾十到幾百個蛋白;
      重復性高，可以實現四個數量級的定量，變異小;
      不需要抗體，因此適用于驗證及定量因缺少抗體而無法采用werstern或者ELISA進行定量的蛋白，如同源較高的蛋白家族，帶有翻譯后修飾蛋白（如磷酸化，甲基化蛋白等等），植物、微生物、模式生物的蛋白
                                    mrm實驗結果圖（部分）
         itraq實驗中差異蛋白后續驗證;
        label free 差異蛋白后驗證;
       蛋白絕對定量;
       肽段絕對定量;
       疾病標志物定量，建立診斷模型;
       磷酸化蛋白定量，甲基化蛋白定量;
       其他翻譯后修飾蛋白定量;
       通路整體蛋白定量分析。        蛋白提取物：濃度>1μg/μl，蛋白質總量 >600μg;

       細胞樣品：細胞量>107  

       組織樣品：動物、微生物組織濕重>10mg
                                           植物組織 > 200mg

       體液樣品：血液體積>1ml    [1]  Chen Chen, Xiaohui Liu, Weimin Zheng, Lei Zhang, Jun Yao, and Pengyuan Yang，Screening of Missing Proteins in the Human Liver Proteome byImproved    MRM-Approach-Based  Targeted Proteomics ，Journal of Proteome Research  2014, 13, 1969-1978
   [2]  Han Sun, Chen Chen, Baofeng Lian, Menghuan Zhang, Xiaojing,Wang, Bing Zhang, Yi-Xue Li, Pengyuan Yang, and Lu Xie  Identification of HPV integration and gene mutation in HeLa  cell line by integrated analysis of RNA-Seq and MS/MS data   J. Proteome Res., Just Accepted                    Manuscript • Publication Date (Web): 20 Feb 2015
   [3]  Picotti P, Aebersold R. Selected reaction monitoring-based proteomics: workflows, potential, pitfalls and future directions. Nature Methods. 2012; 9(6): 555-66.
   [4]  Addona TA, Shi X, et al. A pipeline that integrates the discovery and verification of plasma protein biomarkers reveals candidate markers for cardiovascular disease. Nature Biotechnol. 2011; 29(7): 635-43.

 

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