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糖基化后修飾
技術概述
蛋白質的N-糖基化位點修飾是重要的蛋白質翻譯后修飾之一,主要在復雜的多細胞或組織
形成過程中起關鍵作用。蛋白質的N-糖基化修飾位點具有保守的氨基酸序列NX(S/T),
其中X為除脯氨酸以外的其它氨基酸。
技術原理
凝素親和法是目前糖蛋白質組學中應用較為廣泛的分離富集方法。凝集素(lectin)是一類糖
結合蛋白質,能專一識別某一特殊結構的單糖或聚糖中特定的糖基序列而與之結合,它們與糖鏈
可逆非共價結合,糖蛋白或糖肽被凝集素捕獲之后,通常用特定的單糖通過競爭結合凝集素將
糖蛋白或糖肽洗脫下來。
蛋白質經過酶解后利用凝集素(lectin)富集N-糖基化肽段,然后用N-糖酰胺酶(PNGase)
在H218O中切除連接在天冬酰胺殘基(Asn)上的糖鏈。該處理致使Asn分子量增加2.9890Da。
最后用高精度LC-MS質譜儀檢測脫糖后的肽段,并通過MASCOT軟件檢索數據庫,確認脫糖后
分子量與其理論分子量的變化以及糖基化修飾肽段的序列,從而確定該蛋白質的N-糖基化位點。
N-糖基化位點確定之后,再利用
label-free
的原理對其進行定量分析。
實驗流程
優勢及應用領域
大規模的蛋白質組N-糖基化位點的鑒定與分析
應用于疾病機理研究 、信號傳導途徑分析等
樣品要求
SDS-PAGE條帶 5個以上可見考染條帶;
溶液(目標蛋白質) 目標蛋白質總量>50μg
目標蛋白質純度>80%;
溶液(大規模蛋白質組) 濃度>1μg/μl,
蛋白總量>1mg
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